以上是总体分配原则，但在具体分配做法上各地区、各种形式的股份合作制又有所不同。

（六）治理结构。

总体上看，股份合作制企业大都采取股份公司的典型治理结构，即股东（代表）大会作为权力机构；董事会作为股东（代表）大会闭会期间的代理机构，执行决策权力；经理层为执行系统；监事会独立监督，形成决策、执行、监督三权分立、三位一体的相互联系、相互制约的运行机制。

股份合作制企业中的社会股为优先股，股东一般不享有选举权、被选举权与表决权，而企业员工绝大多数均为投资入股者。根据上述特点，企业实行股东代表大会和职工代表大会合一制度。股东（职工）大会为企业最高权力机构，企业职工通过参加股东（代表）大会对企业重大事务进行表决，通过选举董事会间接实现对企业的领导与控制。在国家股、社会法人股和社会自然人股为优先股和持股大体均衡的条件下，一人一票与一股一票的结果是基本一致的。为了适当照顾本企业职工中持大股的利益，可以按一定比例增加其表决票数，但最多不得超过三票。

股东（代表）大会有以下职权：决定企业的经营方针、发展计划、投资方案和重大经营活动；审议、通过董事会和监事会报告；批准企业年度预、决算方案和利润分配方案；选举或罢免董事会和监事会成员，决定其报酬及支付方法；对吸收新股东、职工股东转让股份作出决议；对企业的分立、合并、终止和清算等重大事项作出决议；制定和修改企业章程；企业章程和规定的其他权力。

企业董事会为企业常设权力机构，其人选由股东会协商选举产生，同时征求上级党委的意见。董事会在对经营决策进行表决时一般采取一人一票制，特殊情况下可采取分类投票制，如股份合作制企业设有社会股或国有股，为防止企业内部股东侵犯其权益，可在决定涉及优先股股东权益时，通知该类股股东参加会议并行使表决权，优先股股东表决应实行一股一票制。

企业实行股份合作制改制后，“新三会”（股东大会、董事会、监事会）与“老三会”（党委会、职代会和工会）的关系也需要重新安排。企业改制后，由于财产关系发生了根本变化，权力基础也随之变化，因此，应当以财产主体即股东（代表）大会为核心建立起新的企业组织领导体系。具体可采取交叉任职、职能合并的办法，如党委书记由董事长兼任；工会职能和监事会接近，可由监事会主席兼任工会主席。

（七）优惠政策。

企业推行股份合作制改革，需要两方面的条件，一是企业有资产可买，二是有人愿意出资产购买。因此，政府要为企业改制创造相对有利的环境。主要包括以下几方面：

1.整体或部分出售企业净资产时，职工一次性付款有困难的，可分期付款，但付款期最长不超过三年，且第一次认购付款必须占全部金额的30％以上；也可以采取适当奖励股份或出售价格优惠等办法，鼓励职工一次性缴足购股款。

2.对资不抵债的企业财政予以支持。资不抵债数额较小的国有企业，可按零资产出售，其差额部分，可由政府用财政资金、小企业转让资金或改制后返还所得税方式，一次或分期补齐。

3.对国有资产数额较大或职工购买有困难的企业，可以采取以下措施：一是将未出售的国有资产作为改制企业负债有偿使用，税后交纳资产占用费；二是出售转让国有资产收回的资金，可以供给企业有偿使用，按低于银行同期贷款利率计缴利息，对需要支持发展和有困难的企业，利息可以在一定年限内实行减、缓、免。

4.为了形成先改制先得益、先改制先主动的机制，对率先改制的国有企业，经国有资产出资人同意，可将国有股1年～3年内所分税后红利作为留利留在企业，用于补充企业流动资金或冲减历史债务。同时，企业自改制之日起三年内，所得税增量部分由财政返还。

5.困难企业进行股份合作制改制的，经政府财政部门批准，可以改制前一年应缴的所得税为基数，超基数部分，前两年由财政先征全额返还，后三年减半返还。