1.本罪与诈骗罪
虚报注册资本本身就含有欺诈的手段，即骗得虚假注册，骗取公司登记，但就其构成而言，与诈骗罪不同。这主要体现在下列4 个方面：（1）犯罪客体不同。虚报注册资本罪侵犯的是公司登记管理制度， 属于妨害对公司、企业的管理秩序一类犯罪，而诈骗罪侵犯的是公私财产所有权。（2）犯罪客观方面不同。 虚报注册资本罪只能发生在申请公司登记的过程中，采用种种欺诈手段虚报注册资本，骗取公司登记，犯罪对象是公司登记主管部门，而并不直接与财物发生关系。诈骗罪则可以发生在任何情况下，只要行为人隐瞒事实真相或者虚造假象，骗取他人财物的即构成犯罪。（3）犯罪主体不同。 虚报注册资本罪的主体是特殊主体，即申请公司登记的人或者单位，诈骗罪的主体是一般主体，而且只能是自然人。（4）主观方面不同。两罪虽然都是故意犯罪， 但虚报注册资本罪的目的是以欺诈手段虚报注册资本，骗取公司登记，而诈骗罪的目的是骗取公私财物。
仅从犯罪构成要件上分析，两罪的界限是非常明确的，但涉及到具体案件的定性，则有不同认识。例如，对虚报注册资本骗取公司登记后，打着公司的招牌骗取他人财物的案件如何定性？有一种观点认为，这属于虚报注册资本罪与诈骗罪竞合，应依照处理想象竞合犯的原则处断，定诈骗罪。（注：参见杨春洗、高格主编：《我国当前经济犯罪研究》，北京大学出版社1996年版，第483页。）另一种观点认为， 行为人分别构成虚报注册资本罪和诈骗罪，可按数罪实行并罚。（注：参见赵秉志：《刑法各论问题研究》，中国法制出版社1996年版，第283页。）笔者认为，对此类案件不能一概而论，而应根据不同案件的具体情况加以斟别，确定罪名。如果行为人为了骗取财物，以虚报注册资本骗取公司登记为手段，获得他人信任，骗取贷款或者其他财物后逃遁，虚报注册资本的手段行为与诈骗的目的行为构成牵连关系，按照刑法理论上处理牵连犯从一重处断的原则，对行为人以诈骗罪论处。如果行为人虚报注册资本时就是为了骗取公司登记，没有骗取他人财物的故意，后来在经营活动中产生骗取他人财物的主观意图并实施诈骗活动，不存在一个犯罪意图下的手段行为与目的行为的牵连关系，则应以虚报注册资本罪和诈骗罪分别定罪，二罪并罚。
2.本罪与妨害公文、证件、印章的犯罪
从司法实践中反映出的案例看，虚报注册资本骗取公司登记的行为，往往又与妨害公文、证件、印章的犯罪交织在一起，通过仿造公文、证件、印章的手段以达到其骗取公司登记的目的。这涉及到本罪与《刑法》第280条第1款规定的伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪及第280条第2款规定的伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪的牵连关系。按照处理牵连犯的原则，这类案件可以划分为两种情况：第一，在申请公司登记过程中，有伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章行为的，以伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪论处，而对虚报注册资本这一目的行为不再单独定罪。根据《公司法》的规定，设立股份有限公司必须经过国务院授权的部门或省级人民政府批准，并按照法定条件进行公司注册登记。对于有限责任公司，一般可登记为公司，不采取统一由行政主管部门审批的制度，但对特定行业和项目，法律、行政法规定在公司登记前必须报经有关部门审批的，则须经过批准。目前，对煤炭、矿山资源、药品生产、烟草制品、金融等行业，国家采取审批后方可申请公司登记的方式。行为人为了在特定行业或对特定项目骗取公司登记，而伪造、变造、买卖国家有关部门批件的，由于我国《刑法》第280条第1款法定刑重于第158条法定刑， 因而以伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪论处。如果是单位行为，因为单位不能成为上述犯罪的主体，对单位仍以虚报注册资本罪论处。第二，在申请公司登记过程中，有伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章行为的，以虚报注册资本罪论处，而对伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章这一手段行为不再单独定罪。行为人在出具虚假证明文件或者采取其他欺诈虚报注册资本时，往往伪造公司、事业单位的印章进行虚假验资，骗取公司登记。由于伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪的法定刑上限为3年以下有期徒刑， 与虚报注册资本罪相同，但其规定了管制刑，虚报注册资本罪的法定刑中未规定上述较轻的主刑种，因而以虚报注册资本罪论处。
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