3月31日，东航云南分公司部分航班返航一事发生后，东航迅速组织运力恢复航班正常。东航总部于当日派出工作小组赶赴昆明调查处理，收集和封存了有关气象和飞行数据资料，主动与政府部门沟通，并向相关部门提供了资料。

通过对相关数据的分析及与当事人的调查谈话，初步显示从3月31日到4月1日的21个返航航班中，有部分航班并非当时机组所反映的“天气原因”返航，存在明显的人为因素。

东航云南分公司已对涉嫌人为原因返航的当事人实施暂时停飞、接受调查的处理。待调查结束后，将本着事实求是的原则，依法依纪进一步做出严肃处理。东航股份公司已责成东航云南分公司两名主要负责人停止履行职务，同时派出股份公司副总经理李养民代理云南分公司总经理。

事发当日，东航已按规定对部分旅客当场做了补偿。对于受航班返航影响的其他旅客，东航将一并给予补偿。对于此次事件中给旅客带来的诸多不便，给社会带来的不良影响，东航再次表示深深的歉意。

东航表示，此事件反映出其在管理中存在薄弱环节。东航将认真汲取教训，努力改进工作。东航向全社会承诺:坚持安全第一，坚决维护国家利益，坚决维护旅客利益，全面履行社会责任，诚实守信，忠于职守，竭诚为旅客提供优质服务。