最高人民法院2000年10月30日以法发［2000］26号向各省、自治区、直辖市高级人民法院，解放军军事法院，新疆维吾尔自治区高级人民法院生产建设兵团分院印发试行的《民事案件案由规定》明确： 第一审法院立案时可根据当事人的起诉确定案由。当事人起诉的法律关系与实际诉争的法律关系不符时，结案时以法庭查明的当事人之间实际存在的法律关系作为确定案由的依据，例如名为联营实为借贷的，定为借款纠纷。当事人在同一起诉中涉及不同法律关系，如某一案件涉及主从合同关系的，根据主合同所涉及的法律关系确定案由。当事人仅因为从合同发生争议，按照从合同涉及的法律关系及当事人的争议确定案由，如担保合同效力纠纷。
借款合同纠纷案由包括以下两种，即借款合同纠纷和民间借贷纠纷。
借款合同纠纷又包括：
（1）（金融机构）同业拆借纠纷
（2）企业之间借款纠纷
